La Biblioteca, che ancora oggi ha sede presso l‘Istituto San Pietro, di pari passo con le vicende dell‘Istituto di formazione teologica, ha subito cambiamenti e ampliamenti tra il 1955 ed il 1960, anno in cui assunse il nome attuale.

Nel corso degli anni sono stati effettuati significativi ampliamenti grazie ai quali ha assunto l‘attuale struttura che consta di una sala lettura e consultazione e di due ampi locali suddivisi in più sale destinate al deposito e alla custodia dei libri e delle riviste.

Oggi la Biblioteca San Giuseppe è un importante strumento di supporto scientifico alle attività formative dell‘attuale Istituto Filosofico-Teologico San Pietro che, dalla fine degli anni ‘90, rappresenta l‘unione dei tre istituti teologici che fino ad allora avevano operato a Viterbo (oltre all‘Istituto Filosofico - Teologico dei Giuseppini del Murialdo, vi erano il Seminario interdiocesano e l‘Istituto Filosofico-Teologico S. Paolo dei Frati Cappuccini).